バイオテクノロジー

微生物ゲノムDNA

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NBRCでは下記の微生物ゲノムDNAを提供しています。微生物ゲノムDNAの申し込み方法は「微生物ゲノムDNAのお申し込み方法」でご確認ください。

ゲノムDNA提供可能微生物株一覧

2021年12月更新
■Fungi and Yeasts
NBRC番号 微生物名 株名 由来株名 注記（ゲノム塩基配列決定株）
100959G Aspergillus oryzae NBRC 100959 = RIB 40 [DBRP] ※1
0622G Candida glabrata NBRC 0622   [NCBI]
1400G Candida tropicalis NBRC 1400   [NCBI]
1136G Saccharomyces cerevisiae NBRC 1136 = S288C [NCBI]
101557G Saccharomyces cerevisiae NBRC 101557 = Kyokai no.7 [DBRP] ※7
111645G Schizosaccharomyces pombe NBRC 111645 = L972 [NCBI] ※2
31329G Trichoderma reesei NBRC 31329   [NCBI]
■Bacteria NEW!!
NBRC番号 微生物名 株名 由来株名 注記（ゲノム塩基配列決定株）
3283G Acetobacter pasteurianus NBRC 3283 = 46 [NCBI]
100883G Acidiphilium multivorum NBRC 100883 = AIU 301 [DBRP]
109760G Acinetobacter lwoffii NBRC 109760T = Lwoff(1) [DBRP]
[NCBI]
102363G Actinoplanes missouriensis NBRC 102363T = 431 [DBRP]
[NCBI] ※2
15112G Amphibacillus xylanus NBRC 15112T = Ep01 [DBRP]
[NCBI]
100420G Anaerolinea thermophila NBRC 100420T = UNI-1 [DBRP]
105658G Armatimonas rosea NBRC 105658T = YO-36  
15539G Bacillus atrophaeus NBRC 15539T = 213 [DBRP]
[NCBI]
15713G Bacillus badius NBRC 15713T = ATCC 14575 [DBRP]
[NCBI]
15305G Bacillus cereus NBRC 15305T   [NCBI]
13626G NEW!! Bacillus circulans NBRC 13626T = 26 [DBRP]
[NCBI]
15565G NEW!! Bacillus cohnii NBRC 15565T = RSH [DBRP]
[NCBI]
102427G NEW!! Bacillus drentensis NBRC 102427T = IDA 1967 [DBRP]
[NCBI]
12092G Bacillus pumilus NBRC 12092T = 272  
13719G Bacillus subtilis subsp. subtilis NBRC 13719T   [DBRP]
100599G Brevibacillus brevis NBRC 100599 = 47 [DBRP]
[NCBI]
104884G Burkholderia plantarii NBRC 104884T = AZ 8201 [NCBI]
100824G Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis NBRC 100824T = MB4 [NCBI] ※3 ※4
104410G Caldisericum exile NBRC 104410T = AZM16c01 [DBRP]
12681G NEW!! Citrobacter freundii NBRC 12681T = AJ 2619 [DBRP]
[NCBI]
13948G Clostridium acetobutylicum NBRC 13948T = 2291 [NCBI] ※2
101661G Hungateiclostridium clariflavum NBRC 101661T   [DBRP]
[NCBI]
12016G Clostridium kluyveri NBRC 12016T = K-1 [DBRP]
[NCBI]
14293G Clostridium sporogenes NBRC 14293   ※2
103400G Hungateiclostridium thermocellum NBRC 103400T = VPI 7372 [NCBI]
100395G Corynebacterium efficiens NBRC 100395T = YS-314 [DBRP]
[NCBI]
12168G Corynebacterium glutamicum NBRC 12168T = 534 [NCBI]
107605G Cutibaterium acnes NBRC 107605T   [DBRP]
[NCBI]
101012G Deferribacter desulfuricans NBRC 101012T = SSM1 [DBRP]
[NCBI] ※4
100478G Enterococcus casseliflavus NBRC 100478T = 20 [DBRP]
[NCBI]
100678G Enterococcus disper NBRC 100678T = E18-1
= Terumo1432		  
100479G Enterococcus durans NBRC 100479T   [DBRP]
[NCBI]
100481G Enterococcus faecalis NBRC 100481T = Tissier  
100486G Enterococcus faecium NBRC 100486T = serotype 11 [DBRP]
[NCBI]
100675G Enterococcus gallinarum NBRC 100675T = F87/276 [DBRP]
[NCBI]
100491G Enterococcus pseudoavium NBRC 100491T = 47-16 [DBRP]
[NCBI]
100492G Enterococcus raffinosus NBRC 100492T = CDC 1789-79 [DBRP]
[NCBI]
107761G Escherichia albertii NBRC 107761T = R-14430 [DBRP]
[NCBI]
12713G Escherichia coli NBRC 12713 = W3110 [NCBI]
105704G Escherichia hermannii NBRC 105704T   [DBRP]
[NCBI]※2
102420G Escherichia vulneris NBRC 102420T   [DBRP]
[NCBI]※2
100505G Gemmatimonas aurantiaca NBRC 100505T = T-27 [DBRP]
[NCBI]
13315G Geodermatophilus obscurus NBRC 13315T = G-20 [NCBI]
※3
16485G Hydrogenobacter subterraneus NBRC 16485T = HGP1  
110686G Ideonella sakaiensis NBRC 110686T = 201-F6 [NCBI]
14216G Kitasatospora setae NBRC 14216T = KM-6054
= KCC A-0304		 [DBRP]
[NCBI]
14940G Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae NBRC 14940T = KM 2924 [DBRP]
103217G Kocuria rhizophila NBRC 103217 = DC2201 [DBRP]
[NCBI]
3288G Komagataeibacter medellinensis NBRC 3288T = 51 [DBRP]
[NCBI]
Synonym: Gluconacetobacter medellinensis
13120G Lactobacillus acetotolerans NBRC 13120 = RIB 9124 [DBRP]
100934G Lactococcus garvieae NBRC 100934T = 0159 [DBRP]
[NCBI]
100676G Lactococcus lactis subsp. cremoris NBRC 100676T   [DBRP]
[NCBI]
100931G Lactococcus lactis subsp. hordniae NBRC 100931T = HC-1 [DBRP]
[NCBI]
100933G Lactococcus lactis subsp. lactis NBRC 100933T = OJ [DBRP]
[NCBI]
100936G Lactococcus plantarum NBRC 100936T = 5L [DBRP]
[NCBI]※3
100932G Lactococcus raffinolactis NBRC 100932T = 23.C.5. [DBRP]
[NCBI]
15272G Magnetospirillum magnetotacticum NBRC 15272T = MS-1  
101784G Microlunatus phosphovorus NBRC 101784T = NM-1 [DBRP]
[NCBI]
14118G NEW!! Mycolicibacterium vaccae NBRC 14118T = SN920 [DBRP]
[NCBI]
14854G Mycoplasma fermentans NBRC 14854T = PG18 [NCBI] ※3 ※5
14855G Mycoplasma gallisepticum NBRC 14855T = PG31 [DBRP] ※3
14477G Mycoplasma orale NBRC 14477T = CH19299 [DBRP] ※3 ※5
14401G Mycoplasma pneumoniae NBRC 14401T = FH [NCBI] ※2 ※3 ※5
14896G Mycoplasma pulmonis NBRC 14896T   ※3 ※5
14298G Nitrosomonas europaea NBRC 14298 = NS-5-2 [NCBI] ※3
14402G Nocardia brasiliensis NBRC 14402T = 337 [DBRP]
[NCBI]
15015G Oerskovia turbata NBRC 15015T = IMET 7405  
102666G Phycisphaera mikurensis NBRC 102666 = FYK2301M01 [DBRP]
[NCBI]
106052G Pseudomonas aeruginosa NBRC 106052 = PAO1 [NCBI]
14159G Pseudomonas alcaligenes NBRC 14159T = RH1577 [DBRP]
[NCBI]
102411G NEW!! Pseudomonas alcaliphila NBRC 102411T = AL15-21 [DBRP]
[NCBI]
12693G Pseudomonas azotoformans NBRC 12693T = F-3 [DBRP]
[NCBI]
3521G Pseudomonas chlororaphis subsp. aureofaciens NBRC 3521T = CCEB 518 [DBRP]
[NCBI]
3904G Pseudomonas chlororaphis subsp. chlororaphis NBRC 3904T = CCEB 292 [DBRP]
[NCBI]
100887G Rhodococcus erythropolis NBRC 100887 = PR4 [DBRP]
[NCBI]
108011G Rhodococcus opacus NBRC 108011 = B-4 [DBRP]
※2 ※7
100245G Rubrivivax gelatinosus NBRC 100245 = IL144 [DBRP]
[NCBI]
100952G Rubrobacter xylanophilus NBRC 100952T = PRD-1 [NCBI] ※2
13245G Salmonella enterica subsp. enterica NBRC 13245T = LT 2
= TM 2		 [NCBI]
3052G Serratia marcescens NBRC 3052 = 80  
105725G Shimwellia blattae NBRC 105725T = CDC 9005-74 [DBRP]
[NCBI]
101211G Sphingobium japonicum NBRC 101211 = UT26S [DBRP]
[NCBI]
103272G Sphingobium sp. NBRC 103272 = SYK-6 [DBRP]
[NCBI] ※7
100910G Staphylococcus aureus subsp. aureus NBRC 100910T = AJ 1060 [DBRP] ※1
13955G Streptococcus mutans NBRC 13955T   [DBRP]
[NCBI]
14893G Streptomyces avermitilis NBRC 14893T = MA-4680 [DBRP]
[NCBI] ※4
13350G Streptomyces griseus NBRC 13350   [DBRP]
[NCBI]
3776G Streptosporangium roseum NBRC 3776 = ip-15 [NCBI] ※2
12172G Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 = d-6 [DBRP]
[NCBI]
103674G Thermosulfidibacter takaii NBRC 103674T = ABI70S6 ※2
100826G Thermotoga maritima NBRC 100826T = MSB8 [NCBI] ※2
101084G Thermus thermophilus NBRC 101084T = HB8 [NCBI]
103022G Vibrio vulnificus NBRC 103022 = P1104-1  
13303G Xanthomonas campestris NBRC 13303   ※1 ※6
■Archaea
NBRC番号 微生物名 株名 由来株名 注記（ゲノム塩基配列決定株）
100138G Aeropyrum pernix NBRC 100138T = K1 [DBRP]
[NCBI]
100126G Archaeoglobus fulgidus NBRC 100126T = VC-16 [NCBI] ※2
100127G Archaeoglobus profundus NBRC 100127T = AV18 [DBRP]
[NCBI] ※4
101032G Haloarcula japonica NBRC 101032T = TR-1 [NCBI]
100440G Methanocaldococcus jannaschii NBRC 100440T = JAL-1 [NCBI] ※2
101707G Methanocella paludicola NBRC 101707T = SANAE [DBRP]
[NCBI]
103675G Methanosaeta concilii NBRC 103675T = GP6 [NCBI]
101360G Methanosaeta thermophila NBRC 101360T = PT [NCBI]
100939G Methanosarcina acetivorans NBRC 100939T = C2A [NCBI] ※2
100474G Methanosarcina barkeri NBRC 100474T = MS 参考：M. barkeri Fusaroゲノム配列 [NCBI]
100330G Methanothermobacter thermautotrophicus NBRC 100330T = ΔH [NCBI] ※4
100828G Picrophilus torridus NBRC 100828T = KAW 2/3 [NCBI] ※4
100827G Pyrobaculum aerophilum NBRC 100827T = IM2 [NCBI]
100139G Pyrococcus horikoshii NBRC 100139T = OT3 [DBRP]
[NCBI]
100439G Pyrodictium abyssi NBRC 100439T = AV 2 ※3
15157G Sulfolobus acidocaldarius NBRC 15157T   [NCBI]
15437G Sulfolobus shibatae NBRC 15437T = B 12  
100140G Sulfolobus tokodaii NBRC 100140T = 7 [DBRP]
[NCBI]
15161G Sulfurisphaera ohwakuensis NBRC 15161T = TA 1  
101555G Thermococcus celericrescens NBRC 101555T = TS2 ※4
15155G Thermoplasma acidophilum NBRC 15155T = 122-1B2 [NCBI] ※2 ※3
15438G Thermoplasma volcanium NBRC 15438T = GSS 1 [NCBI]
100435G Thermoproteus tenax NBRC 100435T = Kra 1 [NCBI] ※3
100879G Vulcanisaeta souniana NBRC 100879T = IC-059 ※2
  1. ※1： 分譲するゲノムDNAには、外国為替及び外国貿易法第四十八条第一項に規定される特定の種類の貨物（戦略物資株）に該当する、または該当する疑いのある遺伝子が含まれています。そのため、日本国外への分譲を行いません。また、分譲のお申し込みの際には、「生物遺伝資源利用誓約書」が必要となりますので、予めご承知おき願います。
  2. ※2： ゲノムDNAの長さは平均10kbp以上となります。
  3. ※3： 最低保証分譲量は500ngとなります。
  4. ※4： ゲノムDNAの長さは平均10kbp以下となります。
  5. ※5： 16S-23S ITS領域をPCR法により確認しています。
  6. ※6： Xanthomonas campestris NBRC 13303は、植物防疫法に基づく輸入検疫有害菌となります。抽出したゲノムDNAは輸入検疫有害菌に該当しませんが、植物防疫所の指示により、分譲依頼者並びに送付先に記載のお名前とご所属、分譲年月日を植物防疫所へ報告いたしますことを予めご承知おき願います。
  7. ※7： 誓約書が必要です。依頼書受領後、メールにて誓約書をお送りしますので、ご記入の上、郵送にてご提出ください。またMTA作成手数料として1サンプルにつき2,640円を頂きます。

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品質確認について

NBRCより分譲している微生物ゲノムDNAにつきましては、下記の品質確認を行っています。

濃度の確認

ゲノムDNA抽出後に濃度を測定し、分譲量が１μg以上であることを確認しています。
（注）一部の微生物株については、最低保証分譲量が500ngとなります。

PCR反応による酵素反応の確認

抽出したゲノムDNAを鋳型とした16S rDNA領域のPCR増幅とその産物の電気泳動を行い、酵素反応が阻害されないことを確認しています。

16S rDNA領域の塩基配列の確認

培養ロット毎に16S rDNA領域の塩基配列を決定し、公共データベース上の塩基配列と一致していることを確認しています。
（注）生物学上培養により突然変異を生じている領域が存在する可能性があります。ご利用される前に目的領域をシーケンス等で確認されることをお薦めいたします。

パルスフィールド電気泳動による長さの確認

培養ロット毎にゲノムDNAの抽出を行い、抽出されるゲノムDNAが20kbp以上の長さとなることを確認しています。
（注）一部の微生物株について、抽出されるゲノムDNAの長さが20kb以上となっていない場合があります。

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微生物ゲノムDNAのお申し込みについて

微生物ゲノムDNAのお申し込み方法

　「生物遺伝資源分譲依頼書（DNA）及び生物遺伝資源の分譲と利用に関する同意書」に必要事項を全てご記入いただき、E-mailにて下記宛にお申し込みください。
（電話でのお申し込みは承っておりません。)
　なお、「生物遺伝資源の名称」の欄には、分譲を希望するNBRC番号を正確に全てご記入ください。

【ご相談・お申し込み先】
独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター(NBRC)
生物資源利用促進課(DNAリソース担当)
E-mail: [email protected]

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NBRC番号について

ゲノムDNAのNBRC番号は、「対応する微生物株のNBRC番号」＋「G」となっております。「G」の記入忘れ等、NBRC番号のご記入には特にご留意ください。
　ゲノムDNAによっては、培養状況・保存状況・法的規制等により今後分譲対象から除外したり、分譲条件等を変更することがあります。

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微生物ゲノムDNAの送付について

ゲノムDNAは、抽出したゲノムDNA（1～3µg）を乾燥品としてお送りします。（一部のゲノムDNAの分譲量は0.5µg以上となります。）
　お送りしたゲノムDNAの品質に問題がありましたら、受領後1ケ月以内にご連絡ください。

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微生物ゲノムDNAの分譲手数料について

分譲手数料は、「ゲノムDNAの分譲手数料が確認できるページ」からご覧ください。

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お願い

  1. １．入手したゲノムＤＮＡをさらに第三者に分譲することはご遠慮ください。
  2. ２．本ゲノムＤＮＡを用いて得られた成果を論文や学会等で公表する際には、
    1. ａ．使用したゲノムＤＮＡのNBRC番号
    2. ｂ．使用したゲノムＤＮＡの分譲元が「NBRC, NITE, Kisarazu, Japan」
    であることを明記いただければ幸いです。また、併せて当該論文の掲載雑誌名や巻号頁数等の情報やPDFファイル等を「成果報告メールの送信」からお送りいただければ幸いに存じます。
  3. ３．本ゲノムＤＮＡを用いて商品開発等をされた場合には、当該商品についての案内を事後で結構ですのでお教えいただければ幸いです。なお、お送りいただきました情報につきましては、NBRCのゲノムＤＮＡをご利用いただいた例として差し支えない範囲でご紹介させていただくこともございます。

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お問い合わせ

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